Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GPX7-201ENST00000361314 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 YBEY-206ENST00000397701 744 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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GBX1Q14549 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ASB6-203ENST00000450050 4535 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
GBX1Q14549 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
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