Protein–RNA interactions for Protein: Q14258

TRIM25, E3 ubiquitin/ISG15 ligase TRIM25, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 630 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM25Q14258 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MARVELD1-201ENST00000285605 3221 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 THTPA-203ENST00000554789 1595 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ABI3-201ENST00000225941 2109 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SFRP4-201ENST00000436072 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AP005901.3-202ENST00000581653 237 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ZBTB11-AS1-201ENST00000609682 2743 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 INPP5B-202ENST00000373023 4694 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 EPB41L3-206ENST00000544123 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CSNK1D-204ENST00000398519 1580 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 UHRF2-201ENST00000276893 3452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CDK10-208ENST00000505473 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TRAF6-201ENST00000348124 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 KCTD15-201ENST00000284006 4918 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ZFYVE1-202ENST00000394207 1183 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FGF13-208ENST00000626909 1039 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 WDR45-202ENST00000356463 1688 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ACSS2-202ENST00000360596 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TPO-203ENST00000346956 2923 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC131009.4-201ENST00000624048 1740 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SALL3-205ENST00000575389 3996 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FUT3-209ENST00000589918 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 FKRP-201ENST00000318584 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GFAP-225ENST00000638281 2099 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 SPDEF-202ENST00000544425 1866 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 GSN-206ENST00000394353 2311 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
TRIM25Q14258 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.1 ms