Protein–RNA interactions for Protein: Q13619

CUL4A, Cullin-4A, humanhuman

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Length 759 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4AQ13619 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRA2B-205ENST00000453386 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC006486.2-201ENST00000624246 2199 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRPC6-206ENST00000532133 2648 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RSRP1-202ENST00000431849 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 KLHDC10-201ENST00000335420 6437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
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CUL4AQ13619 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MAGEA8-201ENST00000286482 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GPC1-201ENST00000264039 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
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CUL4AQ13619 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SHC3-202ENST00000375835 9768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CUL4AQ13619 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CUL4AQ13619 PDE1B-201ENST00000243052 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 C1orf43-202ENST00000362076 1551 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
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CUL4AQ13619 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 C9orf78-201ENST00000372447 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 ADSL-220ENST00000636714 1734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 PRR19-204ENST00000598490 1641 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 AC009802.1-201ENST00000637973 1609 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CUL4AQ13619 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CUL4AQ13619 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
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