Protein–RNA interactions for Protein: Q13564

NAE1, NEDD8-activating enzyme E1 regulatory subunit, humanhuman

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Length 534 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NAE1Q13564 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 LETM2-205ENST00000519476 2240 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
NAE1Q13564 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZFP41-201ENST00000330701 4797 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MTHFR-217ENST00000641820 1569 ntBASIC15.96■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SOWAHB-201ENST00000334306 3220 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 MEX3A-202ENST00000532414 6124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 FAM214B-206ENST00000603301 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
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NAE1Q13564 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 PDCD2-208ENST00000541970 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 COQ8A-202ENST00000366778 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 COL2A1-202ENST00000380518 5071 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ZC3H7B-201ENST00000352645 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
NAE1Q13564 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
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