Protein–RNA interactions for Protein: Q13509

TUBB3, Tubulin beta-3 chain, humanhuman

Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TUBB3Q13509 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC023141.13-201ENST00000604991 943 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC007064.4-201ENST00000637740 555 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NEURL1B-201ENST00000369800 6424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 APCDD1L-AS1-201ENST00000420279 555 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 UCHL1-204ENST00000503431 917 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 UCHL5-206ENST00000367455 5327 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 YARS-201ENST00000373477 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TLE3-215ENST00000559048 2918 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
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TUBB3Q13509 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 AP005117.1-202ENST00000581724 1908 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RABEP1-202ENST00000537505 5365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 EIF2S2-201ENST00000374980 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 COX10-201ENST00000261643 2873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 ZBTB4-202ENST00000380599 5866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
TUBB3Q13509 RPS19-206ENST00000598742 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
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