Protein–RNA interactions for Protein: Q13472

TOP3A, DNA topoisomerase 3-alpha, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,001 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOP3AQ13472 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ING5-213ENST00000636051 4199 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NUP88-207ENST00000573584 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EGLN3-201ENST00000250457 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 OPA1-201ENST00000361150 6330 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RBFOX1-205ENST00000436368 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CALN1-201ENST00000329008 9243 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 BCL11A-203ENST00000358510 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NIN-203ENST00000382041 6496 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CDH1-202ENST00000422392 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 WSCD1-201ENST00000317744 5819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CYP51A1-201ENST00000003100 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ANKHD1-202ENST00000297183 7606 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 POFUT2-214ENST00000615172 2472 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL953897.1-201ENST00000376620 1868 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NBPF14-202ENST00000593495 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CCDC61-202ENST00000594087 1017 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 GHRHR-205ENST00000409904 1613 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 UROC1-202ENST00000383579 2735 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 TFAP2D-201ENST00000008391 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
TOP3AQ13472 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
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