Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 IGHV3-42-201ENST00000520410 361 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.36■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AL138828.2-201ENST00000615812 383 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 WHAMMP3-203ENST00000621139 4494 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 C4orf32-201ENST00000309733 8901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 NOMO2-211ENST00000621364 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AC011491.2-201ENST00000599584 447 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 TMEM161B-AS1-202ENST00000501715 1101 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DRAM1-202ENST00000544152 1048 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TMEM5-AS1-201ENST00000546214 563 ntTSL 4 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 AC116003.1-201ENST00000578340 536 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
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ITGB3BPQ13352 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 LMTK2-201ENST00000297293 8946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 SLC29A2-205ENST00000544554 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ITGB3BPQ13352 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
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