Protein–RNA interactions for Protein: Q13291

SLAMF1, Signaling lymphocytic activation molecule, humanhuman

Predictions only

Length 335 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLAMF1Q13291 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 B4GALNT4-201ENST00000329962 3444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SNHG15-202ENST00000577700 3116 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC080075.1-201ENST00000469747 427 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RAB1A-203ENST00000409784 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 F3-201ENST00000334047 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 EFNB3-201ENST00000226091 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NEO1-201ENST00000261908 7088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
SLAMF1Q13291 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
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