Protein–RNA interactions for Protein: Q12860

CNTN1, Contactin-1, humanhuman

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Length 1,018 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNTN1Q12860 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 EIF5A-201ENST00000336452 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL353705.2-201ENST00000428243 662 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AL512638.1-201ENST00000457493 794 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC004846.2-201ENST00000556578 777 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 SPDYE12P-201ENST00000618416 771 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 HDAC5-201ENST00000225983 5326 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RASA4-202ENST00000449970 2787 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CNTN1Q12860 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CPT2-210ENST00000637252 2739 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 VCX3A-201ENST00000381089 995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SNHG17-203ENST00000417578 880 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 RAB30-AS1-202ENST00000526795 567 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LAMTOR5-208ENST00000614544 846 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SSBP3-205ENST00000417664 1666 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TXNDC2-204ENST00000536353 1703 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CSTB-204ENST00000640406 2354 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 SLC39A13-202ENST00000362021 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 LUC7L3-201ENST00000240304 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 ZGLP1-202ENST00000403903 2303 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 FAM181B-201ENST00000329203 3924 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 USE1-201ENST00000263897 843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL035633.1-201ENST00000406139 838 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 PARD3B-206ENST00000462231 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CNTN1Q12860 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
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