Protein–RNA interactions for Protein: Q0VD83

APOBR, Apolipoprotein B receptor, humanhuman

Predictions only

Length 1,088 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APOBRQ0VD83 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TCOF1-206ENST00000445265 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SCLT1-205ENST00000503401 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TGIF1-201ENST00000330513 1980 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL139398.1-201ENST00000638795 1529 ntTSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 BSG-215ENST00000618006 1329 ntTSL 2 BASIC19.24■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CORO2B-201ENST00000261861 3569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CORO2B-204ENST00000566799 3566 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NEK7-201ENST00000367383 586 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TRIM24-202ENST00000415680 3799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TRPC3-202ENST00000379645 3548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 GSTO1-202ENST00000369713 972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC19.22■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 QRICH1-201ENST00000357496 3083 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
APOBRQ0VD83 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.21■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.9 ms