Protein–RNA interactions for Protein: Q08397

LOXL1, Lysyl oxidase homolog 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 574 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LOXL1Q08397 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 WDR38-201ENST00000373574 1252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CC2D2B-203ENST00000423344 1241 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 RAB35-202ENST00000534951 939 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC007431.3-201ENST00000623221 587 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 USB1-201ENST00000219281 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 YY1AP1-206ENST00000359205 2690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 NPAS3-202ENST00000356141 2802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.24
LOXL1Q08397 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 FAM92A-214ENST00000522324 1072 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 AC008770.3-202ENST00000591944 567 ntTSL 4 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 5S_rRNA.22-201ENST00000614916 106 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 CLN3-201ENST00000333496 1608 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 KAT7-213ENST00000510819 1769 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 AGXT-201ENST00000307503 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC13.52□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
LOXL1Q08397 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms