Protein–RNA interactions for Protein: Q08188

TGM3, Protein-glutamine gamma-glutamyltransferase E, humanhuman

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGM3Q08188 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AHDC1-201ENST00000247087 6334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FNDC5-201ENST00000373471 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 EIF4G1-206ENST00000392537 5229 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AC007193.2-201ENST00000596807 472 ntTSL 3 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 WT1-209ENST00000530998 2421 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MAP3K20-203ENST00000409176 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ARHGDIA-208ENST00000581876 709 ntTSL 3 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 HIST1H2BD-202ENST00000377777 496 ntAPPRIS P1 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 AL355306.1-201ENST00000415580 579 ntBASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.67■□□□□ 0.1
TGM3Q08188 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC15.67■□□□□ 0.1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms