Protein–RNA interactions for Protein: Q04656

ATP7A, Copper-transporting ATPase 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,500 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP7AQ04656 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC008011.2-201ENST00000538113 792 ntTSL 3 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ZBTB45P2-201ENST00000452245 1531 ntBASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AGFG1-202ENST00000373671 1669 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC005915.1-201ENST00000624912 2018 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ZNF22-201ENST00000298299 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FDPS-202ENST00000368356 1431 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC072022.1-201ENST00000450760 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 GTF2H2C-215ENST00000514162 610 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AP001063.1-201ENST00000568332 529 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SLC35A3-217ENST00000639807 2767 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TNFSF8-203ENST00000618336 1523 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 C11orf24-201ENST00000304271 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ADK-202ENST00000372734 2083 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 EPHX2-202ENST00000517536 1600 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ZNF454-202ENST00000519564 2142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 COMT-205ENST00000406520 1339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 RHD-204ENST00000417538 1333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AMT-202ENST00000395338 1831 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SIGLEC12-203ENST00000598614 1434 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 DYNC1I1-203ENST00000413338 958 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SELENOW-201ENST00000509570 881 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC012531.3-201ENST00000513209 777 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 UEVLD-212ENST00000541984 755 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TMEM219-203ENST00000561899 1249 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ARL16-210ENST00000574938 751 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AL034550.2-201ENST00000620523 1771 ntTSL 2 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 LINC01665-201ENST00000422917 1241 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AL133523.1-201ENST00000554537 331 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 COPS9-205ENST00000607357 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PSMC3-212ENST00000602866 1373 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 HACE1-202ENST00000369125 3102 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 FMNL1-201ENST00000328118 2330 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 KCNMB4-201ENST00000258111 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 RBM8A-201ENST00000369307 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
ATP7AQ04656 IGHV3-16-201ENST00000390604 425 ntAPPRIS P1 BASIC23.78■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.2 ms