Protein–RNA interactions for Protein: Q02509

OC90, Otoconin-90, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 493 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OC90Q02509 ZBTB16-202ENST00000392996 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MAPK15-202ENST00000395107 834 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CNN2P2-201ENST00000443536 909 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CNN2P3-201ENST00000450201 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 KRT18P34-201ENST00000488218 1270 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AL136317.3-201ENST00000618497 906 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PPA2-201ENST00000341695 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TULP2-201ENST00000221399 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MAP3K1-201ENST00000399503 7011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC2A6-202ENST00000371899 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PYCR2-201ENST00000343818 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ARHGAP11B-201ENST00000428041 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 LAMTOR4-206ENST00000473459 720 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLBP-205ENST00000488267 987 ntTSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PICALM-219ENST00000532317 3474 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 RIMS3-202ENST00000372684 7235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
OC90Q02509 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 GFRA2-208ENST00000524240 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NEIL2-204ENST00000455213 2323 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CHRNA7-207ENST00000635884 1975 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 NPM1-201ENST00000296930 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
OC90Q02509 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms