Protein–RNA interactions for Protein: Q02487

DSC2, Desmocollin-2, humanhuman

Predictions only

Length 901 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DSC2Q02487 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TVP23A-210ENST00000612195 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC6A9-202ENST00000360584 2330 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 KLF10-202ENST00000395884 3659 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PRAG1-202ENST00000622241 4639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC004461.1-201ENST00000412461 403 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 USP30-AS1-201ENST00000478808 656 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 IGHV3-62-201ENST00000520057 340 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AL591845.1-201ENST00000373137 1838 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 SLC25A35-202ENST00000577745 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 BCAT2-202ENST00000402551 2041 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
DSC2Q02487 TP73-208ENST00000378295 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 ITGA9-AS1-201ENST00000366441 895 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 TEX30-202ENST00000376021 1038 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 HYPK-202ENST00000442995 1051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 RPS3A-212ENST00000514682 985 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
DSC2Q02487 AC134684.3-201ENST00000641758 218 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms