Protein–RNA interactions for Protein: Q02410

APBA1, Amyloid-beta A4 precursor protein-binding family A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 837 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
APBA1Q02410 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SCLT1-208ENST00000506368 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ZBTB17-216ENST00000537142 2511 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PLEKHA2-208ENST00000616927 1748 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 LONRF1-201ENST00000398246 3594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PRPF40B-201ENST00000261897 3602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 LCE1F-201ENST00000334371 357 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 FLJ20021-201ENST00000527564 790 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CLDN6-201ENST00000328796 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 HOXB3-205ENST00000470495 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 WIPI2-211ENST00000484262 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 LINC01144-201ENST00000626198 1710 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 LILRB5-202ENST00000345866 1864 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CUTA-210ENST00000488034 769 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 HPCAL1-207ENST00000620771 1941 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SBNO2-202ENST00000438103 4537 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RNF182-206ENST00000537388 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SLC17A9-201ENST00000370349 2594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.84■□□□□ 0.45
APBA1Q02410 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.6 ms