Protein–RNA interactions for Protein: Q02223

TNFRSF17, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 17, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFRSF17Q02223 MEIS1-AS2-201ENST00000439433 690 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 FAM153C-206ENST00000507848 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 RRBP1-208ENST00000470422 2070 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 KDM6A-212ENST00000543216 5655 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SHISA5-209ENST00000443308 1933 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TNFRSF17Q02223 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GPSM3-206ENST00000375040 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 BTBD11-205ENST00000490090 4614 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ASB1-201ENST00000264607 6994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF18-204ENST00000580306 2330 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NMRK2-201ENST00000168977 1126 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AFG3L1P-209ENST00000429663 458 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NMRK2-205ENST00000616156 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AP3D1-201ENST00000345016 4870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TNFRSF17Q02223 NKIRAS1-204ENST00000416026 795 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 73 ms