Protein–RNA interactions for Protein: Q01831

XPC, DNA repair protein complementing XP-C cells, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 940 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XPCQ01831 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 BAG5-201ENST00000299204 4848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SEPT2-245ENST00000616972 3446 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CSHL1-203ENST00000346606 659 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PPDPF-201ENST00000370177 627 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACYP1-206ENST00000555694 565 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC009093.8-202ENST00000562902 677 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 IGHV3OR16-13-201ENST00000562905 353 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC243960.2-201ENST00000600996 747 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL022328.1-201ENST00000610050 478 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL132857.2-201ENST00000634305 1737 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL645728.1-201ENST00000366221 2101 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SH3YL1-206ENST00000405430 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RAB11FIP2-202ENST00000369199 6119 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 N4BP2L1-210ENST00000613078 2032 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACTG1P3-201ENST00000431775 1114 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 TBP-207ENST00000616883 1750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EXOC5-201ENST00000340918 2632 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 FKBP8-201ENST00000222308 1710 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 MOGAT3-202ENST00000379423 933 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AP002748.3-205ENST00000525142 567 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AP002748.3-203ENST00000533502 581 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 EMC4-209ENST00000559421 497 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 AC009542.2-202ENST00000619004 1067 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XPCQ01831 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPCQ01831 PRG2-202ENST00000525955 1367 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPCQ01831 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPCQ01831 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XPCQ01831 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TJP3-205ENST00000587686 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XPCQ01831 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 88.9 ms