Protein–RNA interactions for Protein: Q00444

HOXC5, Homeobox protein Hox-C5, humanhuman

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC5Q00444 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CRB3-204ENST00000600229 1078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PLEKHN1-201ENST00000379407 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PDGFA-203ENST00000402802 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CCDC189-204ENST00000541260 1531 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL365203.3-201ENST00000609742 2057 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CLDN14-205ENST00000399139 1231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ACP6-203ENST00000487562 1258 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 RAP1B-228ENST00000542145 1060 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL160237.2-201ENST00000556165 472 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 LINC01270-201ENST00000371639 2281 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC007728.2-201ENST00000563315 2296 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 TBX5-203ENST00000405440 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 DIRAS2-201ENST00000375765 4386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GRHPR-201ENST00000318158 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC010654.1-201ENST00000615722 808 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 MCF2L-232ENST00000535094 3752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 GRIK5-204ENST00000593562 3308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
HOXC5Q00444 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FBN1-205ENST00000560355 4109 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
HOXC5Q00444 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.2 ms