Protein–RNA interactions for Protein: Q00059

TFAM, Transcription factor A, mitochondrial, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TFAMQ00059 AC099398.1-201ENST00000567919 2776 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.72■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 GDPD5-214ENST00000533784 2441 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ZNF576-206ENST00000533118 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.43
TFAMQ00059 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC17.71■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SHTN1-202ENST00000355371 5361 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.71■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SQLE-201ENST00000265896 2961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AL021453.1-201ENST00000333487 2989 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ETNK1-202ENST00000335148 1083 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GMFG-207ENST00000598034 1028 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AC244153.1-202ENST00000617855 482 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC17.7■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC17.69■□□□□ 0.42
TFAMQ00059 CAPG-205ENST00000409921 1195 ntTSL 1 (best) BASIC17.69■□□□□ 0.42
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms