Protein–RNA interactions for Protein: P78356

PIP4K2B, Phosphatidylinositol 5-phosphate 4-kinase type-2 beta, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIP4K2BP78356 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC011495.3-201ENST00000596472 427 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 IFI27-206ENST00000612813 725 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 PCSK6-221ENST00000632686 1210 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ROR1-201ENST00000371079 5832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 KCNH2-202ENST00000330883 3267 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 HCN4-201ENST00000261917 7228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC092634.5-202ENST00000587736 928 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AL136301.1-201ENST00000615830 422 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LINC00595-217ENST00000635545 549 ntTSL 4 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ARID1B-222ENST00000637003 1290 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GALNT2-201ENST00000366672 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AC093525.9-201ENST00000624961 1746 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 UBXN11-207ENST00000374223 1312 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LINC00315-201ENST00000441947 2323 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ULK3-220ENST00000569437 2611 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 PIK3IP1-202ENST00000402249 999 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AGTRAP-206ENST00000452018 809 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 MRAS-205ENST00000474559 856 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GDNF-AS1-201ENST00000503382 604 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 AL645941.3-201ENST00000580587 577 ntTSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PIP4K2BP78356 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TMEM53-202ENST00000372237 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NR1D2-201ENST00000312521 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FGFR3-202ENST00000340107 4293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.08■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 MXD3-202ENST00000427908 2269 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 KRTAP21-2-201ENST00000333892 440 ntAPPRIS P1 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NFYC-202ENST00000372651 1202 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AP001790.1-201ENST00000511947 570 ntTSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC108134.3-202ENST00000571404 1207 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 FXYD6-217ENST00000584394 669 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TLDC2-203ENST00000602922 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 AC008132.1-202ENST00000342005 1389 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 DUSP14-204ENST00000613659 1559 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
PIP4K2BP78356 NFE2-202ENST00000435572 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 141.4 ms