Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HHIP-202ENST00000434550 1770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC008969.1-201ENST00000550135 6438 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRMT1-217ENST00000532489 1686 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PSMD9-201ENST00000261817 2307 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MIB1-201ENST00000261537 9576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BBS5-201ENST00000295240 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM222B-202ENST00000452648 2836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PDHA1-203ENST00000379805 734 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 OVCA2-201ENST00000572195 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 DEF8-228ENST00000610455 816 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRKN-208ENST00000610470 531 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PRKN-209ENST00000612485 225 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 TSPY4-205ENST00000640033 663 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LINC00668-206ENST00000581725 1902 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 KCNQ2-209ENST00000625514 2925 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ADAM15-208ENST00000447332 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MAD1L1-202ENST00000399654 2762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PTH2-201ENST00000270631 459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 IGKV4-1-201ENST00000390243 538 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PLA2G12A-202ENST00000502283 1189 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 BRICD5-202ENST00000562360 783 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 SPINT1-AS1-202ENST00000564302 643 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 MIF4GD-205ENST00000578305 569 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 ASAH1-201ENST00000262097 2618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
HERVK_113P63132 NLE1-202ENST00000442241 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.3 ms