Protein–RNA interactions for Protein: P62995

TRA2B, Transformer-2 protein homolog beta, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRA2BP62995 BTBD1-201ENST00000261721 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 NUCB1-202ENST00000407032 2158 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 COL4A1-204ENST00000543140 2547 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 HOXB5-201ENST00000239151 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SNX14-210ENST00000505648 3193 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 DVL1-202ENST00000378891 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC087289.2-201ENST00000587267 1419 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CDC42BPG-201ENST00000342711 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 HAUS4P1-201ENST00000406739 1145 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 C21orf33-205ENST00000427803 1077 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 BRF1-219ENST00000551787 824 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 UCKL1-201ENST00000354216 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SHISA5-208ENST00000442747 2250 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 NKG7-201ENST00000221978 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PQLC3-202ENST00000402361 696 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AL049569.1-201ENST00000446261 636 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 KDM5C-202ENST00000375379 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TIMM44-201ENST00000270538 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
TRA2BP62995 TOM1L2-201ENST00000318094 2259 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms