Protein–RNA interactions for Protein: P57075

UBASH3A, Ubiquitin-associated and SH3 domain-containing protein A, humanhuman

Predictions only

Length 661 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBASH3AP57075 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZFPM1-205ENST00000569086 563 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MTDHP4-201ENST00000600287 670 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GABRA5-202ENST00000355395 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GCK-203ENST00000395796 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 HDAC5-202ENST00000336057 5040 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ABHD11-203ENST00000395147 812 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CR381653.1-203ENST00000625153 577 ntTSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KLHL42-201ENST00000381271 6703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC022613.1-201ENST00000536835 2530 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ACOX3-202ENST00000413009 2374 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PKD1P5-201ENST00000532415 10291 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RPS15-207ENST00000591032 550 ntTSL 3 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
UBASH3AP57075 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms