Protein–RNA interactions for Protein: P56377

AP1S2, AP-1 complex subunit sigma-2, humanhuman

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP1S2P56377 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MIR940-201ENST00000401276 94 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PGAM5P1-201ENST00000518923 814 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FAM86C2P-203ENST00000528684 1004 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SNRPF-201ENST00000266735 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SHISA6-204ENST00000441885 7575 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NHS-201ENST00000380060 8761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CCDC28A-202ENST00000611852 1505 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FCN3-201ENST00000270879 1030 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FCN3-202ENST00000354982 997 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SLC19A2-202ENST00000367804 2976 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TNNC2-202ENST00000372557 780 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AL365330.1-201ENST00000607459 531 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 ANKRD35-202ENST00000544626 3093 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 GAS7-213ENST00000580865 2417 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
AP1S2P56377 AC069281.2-201ENST00000485071 4401 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ZBTB46-201ENST00000245663 5185 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PLEKHB1-202ENST00000354190 2380 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ELFN2-201ENST00000402918 8361 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 DTX2-201ENST00000324432 2769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
AP1S2P56377 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.8 ms