Protein–RNA interactions for Protein: P54725

RAD23A, UV excision repair protein RAD23 homolog A, humanhuman

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23AP54725 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 EXO5-203ENST00000372703 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DZIP1-204ENST00000376829 3738 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC007326.2-201ENST00000624224 7579 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MYO15B-237ENST00000642007 4893 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PLXDC1-201ENST00000315392 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TOMM70-201ENST00000284320 4409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ADAMTS15-201ENST00000299164 5673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 STAT5A-211ENST00000590949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MROH1-207ENST00000528919 5234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 JPH4-201ENST00000356300 4278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 EIF4G1-212ENST00000424196 5653 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DYSF-201ENST00000258104 6796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DYSF-204ENST00000409582 6790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 DYSF-210ENST00000413539 6769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BRF1-205ENST00000440513 2368 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MTA3-203ENST00000406652 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC087164.1-202ENST00000583062 2158 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 OSBPL10-201ENST00000396556 6600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 PAK6-202ENST00000455577 4215 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 BET1L-202ENST00000332865 533 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
RAD23AP54725 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.4 ms