Protein–RNA interactions for Protein: P51157

RAB28, Ras-related protein Rab-28, humanhuman

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB28P51157 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AL513327.2-201ENST00000432703 490 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC109322.1-201ENST00000524499 1264 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SLC25A46-201ENST00000355943 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 KMT5A-201ENST00000330479 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 USP2-202ENST00000455332 2903 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 KDM6A-211ENST00000536777 5633 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ARNTL-201ENST00000389707 2776 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 RASSF8-AS1-202ENST00000500276 2610 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SLC8A2-201ENST00000236877 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GNAL-202ENST00000334049 6535 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AL118508.1-201ENST00000613502 2345 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 LLGL2-209ENST00000578363 1393 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PTTG1-202ENST00000393964 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 SLC25A36-204ENST00000453248 1040 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 PAEP-208ENST00000479141 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
RAB28P51157 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms