Protein–RNA interactions for Protein: P49368

CCT3, T-complex protein 1 subunit gamma, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCT3P49368 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 DGAT2-202ENST00000376262 2324 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SRPX-201ENST00000378533 1874 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 KNOP1-205ENST00000568230 1311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CSF3-203ENST00000394148 622 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 VN2R19P-201ENST00000442399 1052 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HYAL1-206ENST00000447605 666 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SLC26A4-AS1-202ENST00000449741 586 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 INTS11-247ENST00000540437 2629 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ADRA2A-201ENST00000280155 3745 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CMKLR1-204ENST00000550402 1893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TRIM7-201ENST00000274773 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SPN-201ENST00000360121 6894 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GRIN2A-201ENST00000330684 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PHPT1-202ENST00000371661 985 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC009947.1-201ENST00000444350 727 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
CCT3P49368 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ACTR3-208ENST00000535589 1530 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SMARCA2-203ENST00000349721 5761 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 AC093627.6-201ENST00000478759 1365 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
CCT3P49368 ZNF276-201ENST00000289816 4589 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.7 ms