Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCDC157-203ENST00000405659 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CD81-201ENST00000263645 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 WIPF2-210ENST00000585043 2693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TUBB8P12-201ENST00000308911 1335 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TUBB7P-202ENST00000428444 1305 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TUBB8P7-204ENST00000567960 1332 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RNF183-202ENST00000416588 849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AL606534.2-205ENST00000437691 346 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 C3orf67-212ENST00000491845 832 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 STARD4-205ENST00000505803 803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 STARD4-207ENST00000509887 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MFF-223ENST00000524634 647 ntTSL 2 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FAM49B-202ENST00000517654 1817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.31■□□□□ 0.2
FNTBP49356 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KCNC2-203ENST00000393288 2485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SLC39A1-210ENST00000617697 2214 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CCDC28A-201ENST00000332797 1496 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CLK3P2-201ENST00000427566 1453 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HACD3-206ENST00000565299 1465 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PDE6D-201ENST00000287600 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BOLA2P3-201ENST00000404566 256 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ACTBP11-201ENST00000436287 1126 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FLJ27354-203ENST00000526694 851 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AL122035.1-201ENST00000556640 550 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ANKS3-227ENST00000592711 580 ntTSL 4 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC015936.2-201ENST00000593177 259 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MIR8072-201ENST00000614241 80 ntBASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HIST1H2BO-201ENST00000616182 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 UBL3-201ENST00000380680 4384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BVES-202ENST00000336775 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DMRTC2-204ENST00000596827 1675 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 BRINP1-202ENST00000373964 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.3■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DNM3-203ENST00000367733 2322 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DNAJA4-206ENST00000446172 1399 ntTSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM150A-203ENST00000409668 1776 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 HIST1H2AD-201ENST00000341023 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 UBE2T-201ENST00000367274 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC16.29■□□□□ 0.2
FNTBP49356 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC16.29■□□□□ 0.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.4 ms