Protein–RNA interactions for Protein: P42857

NSG1, Neuron-specific protein family member 1, humanhuman

Predictions only

Length 185 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NSG1P42857 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF593-202ENST00000374266 675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC211486.1-202ENST00000416371 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SS18L2-202ENST00000447630 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP001471.1-201ENST00000454245 672 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC211476.1-201ENST00000503899 468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 LINC01225-203ENST00000563550 1244 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC092718.3-202ENST00000564536 1032 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FBXL22-202ENST00000534939 2443 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SPINT1-202ENST00000562057 2456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC25A45-201ENST00000294187 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DHDH-204ENST00000523250 634 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AP000842.3-202ENST00000569238 1080 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AC020934.3-201ENST00000639810 348 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
NSG1P42857 GPX3-210ENST00000622181 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 HS3ST3B1-201ENST00000360954 5367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 AK4-207ENST00000545314 6887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 CACNA1H-206ENST00000565831 7815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 ISG20L2-202ENST00000368219 2310 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
NSG1P42857 C9orf116-202ENST00000371789 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.1 ms