Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 FAM83C-201ENST00000374408 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MOB3B-201ENST00000262244 6454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 VOPP1-207ENST00000428648 2866 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CACFD1-202ENST00000316948 2794 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AL359915.2-201ENST00000425884 745 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 CHMP4A-211ENST00000609024 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
PIK3CBP42338 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC132872.4-202ENST00000622924 2756 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 INTS14-209ENST00000567744 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 105.6 ms