Protein–RNA interactions for Protein: P41235

HNF4A, Hepatocyte nuclear factor 4-alpha, humanhuman

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Length 474 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNF4AP41235 TMEM184A-201ENST00000297477 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 LRP10-201ENST00000359591 6886 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TM4SF19-204ENST00000454715 1061 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AKAP12-201ENST00000253332 6597 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TSPOAP1-202ENST00000343736 5947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SLC37A1-201ENST00000352133 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 BTN1A1-202ENST00000613186 2266 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AQP1-204ENST00000441328 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SIK3-201ENST00000375300 6213 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CLPTM1L-209ENST00000507807 1740 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 GAR1-202ENST00000394631 1011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AL354836.1-201ENST00000414042 681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 REEP2-206ENST00000506158 1021 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SPCS2-202ENST00000526361 772 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ASB7-202ENST00000343276 1694 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MSMO1-202ENST00000393766 1789 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
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HNF4AP41235 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 PKLR-202ENST00000392414 2479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 VIPR1-217ENST00000543411 2681 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SESN1-204ENST00000436639 3509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 SAP130-203ENST00000357702 4173 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 RBPMS-203ENST00000339877 1341 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 NOMO1-207ENST00000610363 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ZNF713-202ENST00000429591 4339 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
HNF4AP41235 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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