Protein–RNA interactions for Protein: P40121

CAPG, Macrophage-capping protein, humanhuman

Predictions only

Length 348 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPGP40121 ARPP19-202ENST00000561650 3245 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NF2-209ENST00000403999 2999 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GRK6P1-201ENST00000400595 1711 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FAM219A-204ENST00000379081 3543 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 POR-201ENST00000394893 2532 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CACNA1G-205ENST00000360761 7497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SMAP1-202ENST00000370452 2491 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ATP5F1-202ENST00000369722 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CYB561-203ENST00000392976 3151 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CDH20-203ENST00000538374 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SCO2-202ENST00000395693 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AL954642.1-201ENST00000428088 538 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MIR4492-201ENST00000581627 80 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 NOS1AP-201ENST00000361897 4931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TEAD3-201ENST00000338863 2983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PMP22-209ENST00000612492 1822 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CICP23-201ENST00000605013 2741 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC114490.1-201ENST00000417456 3163 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 COL11A2-201ENST00000341947 6425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PCBP1-201ENST00000303577 1750 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 WDR97-201ENST00000323662 6916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 ZNF586-203ENST00000396154 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC148477.5-201ENST00000625164 1645 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 POU5F1-204ENST00000471529 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 LINC00996-201ENST00000477392 2043 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 CTNS-203ENST00000399306 803 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 SNORA78-201ENST00000459373 127 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 MOK-234ENST00000524370 1165 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC15.18■□□□□ 0.02
CAPGP40121 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms