Protein–RNA interactions for Protein: P35453

HOXD13, Homeobox protein Hox-D13, humanhuman

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD13P35453 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC17.83■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TMEM110-201ENST00000355083 4769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ACOXL-201ENST00000340561 2188 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL035685.1-202ENST00000637341 1688 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 L1CAM-203ENST00000370055 4655 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SPATS2L-202ENST00000360760 2119 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ZC3H12D-201ENST00000409806 5791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CFLAR-214ENST00000443227 1679 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC245100.5-201ENST00000452108 331 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 RAB1B-202ENST00000527397 991 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL355974.2-201ENST00000614099 556 ntTSL 4 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL355974.2-202ENST00000617298 936 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 LGR6-205ENST00000439764 2487 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC17.81■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ZSCAN2-214ENST00000546148 2242 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 CSRP2-202ENST00000546966 754 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 AC098484.3-202ENST00000603943 1011 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MRPS21-201ENST00000581066 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ATP6V0E2-212ENST00000611515 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 DLX4-201ENST00000240306 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
HOXD13P35453 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms