Protein–RNA interactions for Protein: P30085

CMPK1, UMP-CMP kinase, humanhuman

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMPK1P30085 AC130456.4-201ENST00000568635 665 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CMPK1P30085 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HASPIN-201ENST00000325418 2797 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RCOR3-204ENST00000452621 1827 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HELZ2-202ENST00000427522 7827 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NFATC2-205ENST00000609507 2662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GOLGA6L17P-202ENST00000614358 1398 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CYTH2-204ENST00000452733 4780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CLIC5-202ENST00000339561 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GALE-216ENST00000617979 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 USP42-201ENST00000306177 5155 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TAGLN-206ENST00000530649 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL022328.4-201ENST00000608025 1001 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GHR-201ENST00000230882 4560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GATB-209ENST00000512306 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NCALD-217ENST00000521599 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMEM189-UBE2V1-201ENST00000341698 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 MAPKAP1-208ENST00000394063 2977 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FAM58DP-201ENST00000428076 619 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 KIAA0930-215ENST00000496226 589 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RPL13-214ENST00000567815 712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC084018.2-201ENST00000613093 2607 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 VCX-202ENST00000381059 967 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
CMPK1P30085 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms