Protein–RNA interactions for Protein: P29466

CASP1, Caspase-1, humanhuman

Predictions only

Length 404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP1P29466 HMGXB3-206ENST00000613459 5567 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 MGAT1-201ENST00000307826 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 ZNF764-201ENST00000252797 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TPD52L2-203ENST00000348257 2237 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
CASP1P29466 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RECQL4-209ENST00000617875 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ARHGEF28-211ENST00000512883 2936 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MASTL-203ENST00000375946 3623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HNF1A-215ENST00000615446 2344 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 EIF2AK4-201ENST00000263791 5499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BX640515.1-201ENST00000617215 977 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 DBN1-202ENST00000309007 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GUCD1-204ENST00000407471 3482 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 EGFR-203ENST00000344576 2864 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TIPRL-202ENST00000367833 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 UPK3B-202ENST00000334348 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ADGRB2-201ENST00000373655 5400 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SLC22A18-206ENST00000449793 1225 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 FP565260.3-204ENST00000623795 2238 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MIR137HG-202ENST00000424528 2639 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CASP1P29466 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.4 ms