Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

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Length 1,452 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PTPRMP28827 ZNF581-203ENST00000587252 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CAPZB-201ENST00000264202 858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 STMN1-201ENST00000357865 1137 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 IFI35-203ENST00000415816 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 UBXN1-214ENST00000533000 367 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TCL1A-208ENST00000556450 872 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RPL28-208ENST00000559463 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC011491.1-203ENST00000637688 543 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 U2AF2-201ENST00000308924 1698 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TMEM198-201ENST00000344458 2393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 C12orf76-207ENST00000549724 1302 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TMEM40-201ENST00000264728 984 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 COX5BP1-201ENST00000507622 393 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PGAM1P5-201ENST00000548011 764 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SHBG-212ENST00000575314 1146 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NAT9-212ENST00000581136 1011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 KLK3-202ENST00000360617 1664 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ABHD14B-206ENST00000483233 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZNF414-202ENST00000393927 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 KCNV2-201ENST00000382082 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NRG1-216ENST00000523079 2359 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LYPLA2-202ENST00000374502 1072 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC105389.3-201ENST00000508038 907 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AP007216.2-201ENST00000562094 299 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RDM1-220ENST00000616596 1032 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RDM1-228ENST00000620284 1177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ESR2-209ENST00000555278 1883 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SLCO6A1-202ENST00000389019 2340 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PODXL-201ENST00000322985 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 QPRT-202ENST00000395384 2343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 EIF2B4-205ENST00000445933 1608 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DYNLRB2-201ENST00000305904 497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AL049698.1-202ENST00000441716 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 H2AFY-202ENST00000312469 1859 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 PPM1M-202ENST00000323588 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 DIABLO-201ENST00000267169 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 ICAM3-205ENST00000589261 2024 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 FHIT-208ENST00000492590 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 AL355102.5-201ENST00000554769 572 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SAXO2-207ENST00000566861 404 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 CYB5D1-202ENST00000570446 570 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PTPRMP28827 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC23.48■■□□□ 1.35
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