Protein–RNA interactions for Protein: P28676

GCA, Grancalcin, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCAP28676 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 ACTL9-202ENST00000612068 1252 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 DGKI-201ENST00000288490 3895 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 PIGT-201ENST00000279035 1880 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 NSUN5-203ENST00000428206 2269 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
GCAP28676 POLL-217ENST00000628479 1953 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 BMP2K-201ENST00000335016 3804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SYNE3-203ENST00000554873 2826 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC004922.1-201ENST00000638617 2430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 LOX-206ENST00000639739 1626 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 TIRAP-203ENST00000392680 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 RNU1-129P-201ENST00000384064 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 MAGI2-AS3-203ENST00000424477 520 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC105202.1-201ENST00000517833 995 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC068389.2-201ENST00000529518 430 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 FAM220A-205ENST00000578372 207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 U1.21-201ENST00000580816 167 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 LRCH1-201ENST00000311191 4710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 KDSR-202ENST00000406396 5447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SPRY1-207ENST00000610581 2608 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 SYBU-208ENST00000440310 3072 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 MFNG-201ENST00000356998 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
GCAP28676 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 COPS8-202ENST00000392008 1654 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 MECR-202ENST00000373791 2416 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC105935.2-201ENST00000435478 544 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC093459.1-201ENST00000444567 481 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 ZNF445-205ENST00000617032 1291 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 NDRG2-206ENST00000397844 2096 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 TFRC-202ENST00000392396 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 DGKZ-205ENST00000456247 3482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
GCAP28676 KIAA1841-201ENST00000295031 3116 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 SMAD6-201ENST00000288840 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
GCAP28676 TTLL3-213ENST00000430793 2097 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.2 ms