Protein–RNA interactions for Protein: P28566

HTR1E, 5-hydroxytryptamine receptor 1E, humanhuman

Predictions only

Length 365 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HTR1EP28566 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 EPS8-201ENST00000281172 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 DNM1-208ENST00000486160 3181 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SYNRG-222ENST00000614941 3406 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AQP12A-201ENST00000337801 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 NDUFB2-208ENST00000471136 499 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AC135050.2-203ENST00000529564 725 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TPT1-AS1-215ENST00000522673 1519 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CRAT-201ENST00000318080 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SLC43A2-204ENST00000571650 3261 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 HS6ST2-201ENST00000370833 1938 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AP4B1-204ENST00000369569 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 NPL-204ENST00000367554 3027 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 WASHC2C-204ENST00000374362 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TNFRSF13C-201ENST00000291232 3944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 HFE2-204ENST00000475797 1381 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 GP5-201ENST00000401815 3534 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ZNF197-203ENST00000383744 1989 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MPPED1-202ENST00000417669 3657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AP002449.1-201ENST00000588211 474 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 GRB7-204ENST00000394211 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ZNF767P-201ENST00000463567 3520 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 DKC1-213ENST00000620277 3079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 SERPINF2-203ENST00000450523 1462 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
HTR1EP28566 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms