Protein–RNA interactions for Protein: P28290

SSFA2, Sperm-specific antigen 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSFA2P28290 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 STAC3-206ENST00000554578 1580 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SLC18A1-203ENST00000381608 1419 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AP000347.2-202ENST00000421064 3041 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 HRASLS5-206ENST00000540857 3032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 VAMP4-202ENST00000367740 1193 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 FAM221A-203ENST00000409653 761 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 FAM221A-204ENST00000409994 1136 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TRA2A-212ENST00000621813 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.99■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 RPS5-201ENST00000196551 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SCAND1-201ENST00000305978 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PRAF2-201ENST00000376386 801 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 ZNF589-204ENST00000440261 917 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 IL32-232ENST00000552356 623 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 KLK15-204ENST00000598239 855 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LINC00207-204ENST00000605505 666 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC099568.2-201ENST00000609194 695 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 ISLR2-203ENST00000435464 4259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 BCL2-203ENST00000589955 5011 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SPATA18-202ENST00000419395 2816 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PCDHGC5-202ENST00000610789 2763 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 EEF1B2-201ENST00000236957 844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TRIM17-201ENST00000295033 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 CYB561D2-202ENST00000418577 1533 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 MAPK8IP3-201ENST00000250894 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SSFA2P28290 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms