Protein–RNA interactions for Protein: P26678

PLN, Cardiac phospholamban, humanhuman

Predictions only

Length 52 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLNP26678 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 B3GAT1-203ENST00000524765 5737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TMEM132E-203ENST00000631683 4379 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 STARD8-201ENST00000252336 4862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 WAPL-201ENST00000263070 5987 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 HOXC12-201ENST00000243103 3335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 KCNC3-202ENST00000474951 3347 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 BCL2L12-201ENST00000246784 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 SAPCD2P4-201ENST00000424595 1171 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 PRKCB-209ENST00000498058 480 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ANAPC11-207ENST00000572639 578 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 PLPP3-201ENST00000371250 3292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TINF2-202ENST00000399423 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 PPARGC1B-203ENST00000394320 4803 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 ADAMTS13-205ENST00000371916 4330 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 CLDN22-201ENST00000323319 2581 ntAPPRIS P1 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 C20orf166-AS1-203ENST00000475015 2585 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL049757.1-201ENST00000616842 1596 ntBASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC083805.3-201ENST00000619560 1315 ntTSL 3 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 GPN1-201ENST00000264718 2496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC11.58□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC090826.2-201ENST00000568496 4946 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 MYOM3-202ENST00000374434 5804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 FCER2-202ENST00000360067 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 EVC2-201ENST00000310917 4828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 NUDT16-202ENST00000521288 6108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TNIK-202ENST00000341852 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 NRP2-203ENST00000357785 2926 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 OSBPL8-201ENST00000261183 7239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 OSBPL8-218ENST00000611266 7239 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 CTBP1-AS2-206ENST00000581398 5652 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 UHRF1-204ENST00000616255 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRIM56-201ENST00000306085 10952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 PCDHA11-201ENST00000398640 6115 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 MEAF6-201ENST00000296214 1525 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 C15orf48-201ENST00000344300 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 KRT18P48-201ENST00000434763 852 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
PLNP26678 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC11.57□□□□□ -0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.7 ms