Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CSAD-208ENST00000444623 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HSP90B1-210ENST00000614327 1338 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRLH-201ENST00000165524 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MVB12A-211ENST00000529939 1091 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 OCIAD1-213ENST00000508293 1423 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NR4A3-204ENST00000618101 5706 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBC1D9B-202ENST00000356834 5173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HYAL3-207ENST00000621157 1696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 EHD3-201ENST00000322054 4636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CLCNKA-203ENST00000439316 1997 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SYBU-209ENST00000446070 2919 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PDE1C-201ENST00000321453 2898 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 JPH4-202ENST00000397118 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TCEAL2-201ENST00000329035 1080 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HELT-201ENST00000338875 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms