Protein–RNA interactions for Protein: P23470

PTPRG, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase gamma, humanhuman

Predictions only

Length 1,445 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRGP23470 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AP001056.1-201ENST00000411956 821 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CHL1-AS2-203ENST00000452919 726 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CENPBD1P1-203ENST00000479047 569 ntTSL 3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RRN3-205ENST00000563559 2128 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AL358473.2-201ENST00000610411 556 ntTSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ISLR2-210ENST00000565540 2780 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CD2BP2-203ENST00000569466 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 EIF4E1B-203ENST00000504597 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 E4F1-201ENST00000301727 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DAGLB-202ENST00000425398 2044 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 USP40-206ENST00000443711 628 ntTSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC004898.1-201ENST00000451057 766 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 BX284668.4-201ENST00000453917 508 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TP53AIP1-205ENST00000531399 806 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AP006547.1-201ENST00000563435 692 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 NPR3-204ENST00000434067 2715 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 WNT8B-201ENST00000343737 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 BSG-204ENST00000545507 1795 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RNPS1-223ENST00000568631 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 FAM118B-210ENST00000627851 1862 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 OR5C1-201ENST00000373680 963 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CHIA-209ENST00000483391 1188 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ZNFX1-AS1_1.1-201ENST00000615787 198 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ADCY7-203ENST00000537579 2090 ntTSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CBX3-203ENST00000409747 1717 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 UBE2V2-205ENST00000521346 1322 ntTSL 3 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LSM10-201ENST00000315732 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PFDN6-204ENST00000395131 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AL021707.3-201ENST00000418803 527 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC243562.2-201ENST00000561247 970 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LINC00479-204ENST00000589300 718 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LINC00854-216ENST00000636331 718 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ATP6V1C2-201ENST00000272238 1565 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ADPRHL1-202ENST00000375418 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LGALS12-205ENST00000425950 1789 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ST7L-207ENST00000369669 1743 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ACKR1-201ENST00000368121 1240 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ZNF248-202ENST00000374648 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 AC247036.4-201ENST00000632099 353 ntAPPRIS P1 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PTPRGP23470 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
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