Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 AP4M1-201ENST00000359593 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AP4M1-206ENST00000429084 1836 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PRSS54-204ENST00000567164 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 COX6A2-201ENST00000287490 440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DGUOK-AS1-202ENST00000439192 563 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 UPF3AP2-201ENST00000457924 1132 ntBASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RAB30-AS1-207ENST00000533708 825 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ZSCAN25-201ENST00000262941 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.13■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SH3BGR-201ENST00000333634 1251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LINC01121-201ENST00000378479 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GGCT-203ENST00000409144 836 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC096536.1-201ENST00000443284 440 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GGCT-201ENST00000005374 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC009133.1-202ENST00000563806 494 ntTSL 3 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC022903.1-201ENST00000579327 469 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 LCN9-204ENST00000619315 528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DUSP13-203ENST00000372702 1778 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC138028.6-201ENST00000616106 1482 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 POLG2-201ENST00000539111 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 POLR2J-201ENST00000292614 932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL450003.2-201ENST00000450445 428 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC008687.7-202ENST00000637404 953 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CD209-207ENST00000593660 1497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 COLQ-206ENST00000603808 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
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PTPRBP23467 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 GUK1-206ENST00000366723 845 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 BLCAP-204ENST00000397135 685 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CNN2P10-201ENST00000443067 918 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AKR7A2P1-201ENST00000460134 915 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 ADM-202ENST00000524948 584 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AL021546.1-201ENST00000551806 552 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AP003096.1-203ENST00000564469 563 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC243967.2-201ENST00000601409 567 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 SPCS2P2-201ENST00000603270 608 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
PTPRBP23467 AC091271.1-201ENST00000611877 1162 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
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