Protein–RNA interactions for Protein: P23409

MYF6, Myogenic factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MYF6P23409 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYF6P23409 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYF6P23409 LYSMD4-204ENST00000409796 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYF6P23409 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYF6P23409 SH3BP4-203ENST00000409212 5231 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ST3GAL3-209ENST00000361400 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CNGB1-201ENST00000251102 5641 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CHRNG-202ENST00000389494 2262 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 B3GALNT1-203ENST00000392781 3606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CHTF18-205ENST00000455171 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 NTMT1-207ENST00000482347 1072 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 NAPSB-206ENST00000562112 1266 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 AC073082.1-201ENST00000602369 2103 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 RABIF-201ENST00000367262 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 PPP1R16A-201ENST00000292539 2722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 APBB1-221ENST00000609360 2642 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 COCH-203ENST00000460581 2688 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MYF6P23409 GRK6-203ENST00000393576 2792 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYF6P23409 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYF6P23409 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYF6P23409 PIK3IP1-201ENST00000215912 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYF6P23409 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0.01
MYF6P23409 CNDP1-201ENST00000358821 2215 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 RAB7A-203ENST00000482525 1589 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 GRAP-201ENST00000284154 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 RREB1-204ENST00000379938 8778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 NDUFA11-201ENST00000308961 539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 SIGLEC15-202ENST00000546268 1054 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 SNX21-213ENST00000614929 587 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 MUM1-201ENST00000415183 2837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
MYF6P23409 WASH2P-202ENST00000538033 2800 ntTSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 C1QTNF2-201ENST00000393975 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 SLC4A8-204ENST00000514353 3041 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 ACIN1-203ENST00000357481 2563 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 IVL-201ENST00000368764 2153 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
MYF6P23409 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms