Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 CBY1-211ENST00000619293 1118 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SEPT8-205ENST00000378701 1817 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CLEC17A-202ENST00000417570 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 YTHDF3-215ENST00000621957 2387 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TAF3-201ENST00000344293 4872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PP7080-203ENST00000510604 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PDE4C-201ENST00000262805 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SNX31-201ENST00000311812 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CORO1A-208ENST00000565497 1348 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LRRC59-201ENST00000225972 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NDUFV1-216ENST00000529927 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MIR346-201ENST00000362234 95 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SLC8B1-210ENST00000550047 2493 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.1 ms