Protein–RNA interactions for Protein: P16410

CTLA4, Cytotoxic T-lymphocyte protein 4, humanhuman

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Length 223 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTLA4P16410 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CDH15-201ENST00000289746 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 VARS2-212ENST00000542001 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CADPS2-204ENST00000412584 4308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RAI1-207ENST00000640861 5172 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL139384.1-201ENST00000612143 3047 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC007967.2-201ENST00000432613 625 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 FBXL21-206ENST00000495672 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AK2-210ENST00000548033 936 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 PML-215ENST00000565898 5393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ADAMTSL4-204ENST00000369041 2908 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KCNA5-201ENST00000252321 2800 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 ATP6AP2-201ENST00000378438 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BRCC3-202ENST00000340647 1101 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
CTLA4P16410 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
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