Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 C11orf80-201ENST00000360962 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC026748.1-201ENST00000624349 3251 ntBASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC005264.1-201ENST00000587587 2319 ntTSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 KIAA1191-201ENST00000298569 2991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 HCK-209ENST00000538448 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 FYCO1-205ENST00000535325 8578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ABCB9-216ENST00000542678 6051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
TNNT1P13805 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PCCB-209ENST00000469217 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NFIB-201ENST00000380921 1274 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 GGT1-207ENST00000404532 853 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 Z69720.1-201ENST00000601483 472 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 B4GALNT1-201ENST00000341156 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 EGR3-204ENST00000522910 1553 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PATZ1-202ENST00000266269 3781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 APOA4-201ENST00000357780 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NPRL2-201ENST00000232501 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 UBE2G2-202ENST00000345496 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SFI1-209ENST00000443011 3579 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 GLB1L2-201ENST00000339772 3152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 IPO8-201ENST00000256079 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC116407.4-201ENST00000623319 1061 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 DENND5B-202ENST00000389082 9470 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 ZNF385A-205ENST00000546970 2494 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 MAGEA12-202ENST00000393869 1761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 HDAC11-201ENST00000295757 2960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 USP43-202ENST00000570475 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
TNNT1P13805 RUNDC1-201ENST00000361677 3828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.9 ms