Protein–RNA interactions for Protein: P13612

ITGA4, Integrin alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,032 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA4P13612 AL390955.2-201ENST00000603032 514 ntBASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LENG8-202ENST00000376514 5146 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ACSF3-204ENST00000406948 2247 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SLC6A17-201ENST00000331565 6427 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RNF183-203ENST00000441031 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CLPTM1-203ENST00000546079 2342 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DIMT1-201ENST00000199320 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PRYP6-201ENST00000514804 343 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC092811.2-201ENST00000632561 559 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ATP10A-201ENST00000356865 6680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LMNB2-201ENST00000325327 4671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PCDHA1-201ENST00000378133 2726 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TNNC2-201ENST00000372555 710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SSNA1-204ENST00000464553 723 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 LDOC1-201ENST00000370526 1381 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 DOLK-201ENST00000372586 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
ITGA4P13612 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.1 ms