Protein–RNA interactions for Protein: P11712

CYP2C9, Cytochrome P450 2C9, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP2C9P11712 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ZNF286A-204ENST00000464847 5616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC012414.7-201ENST00000621235 1507 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ADAM23-201ENST00000264377 6330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 KLK8-211ENST00000600767 1324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ZNF789-201ENST00000331410 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TBXAS1-204ENST00000416849 2505 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ING1-204ENST00000375775 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 DIRC3-201ENST00000423123 552 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 KRT17P8-201ENST00000540749 863 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 USP7-201ENST00000344836 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 DAG1-201ENST00000308775 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 UBL7-209ENST00000567435 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 FBXL5-202ENST00000412094 2837 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 CORO6-210ENST00000580212 2345 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 GFOD2-201ENST00000268797 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 LYPLA2-201ENST00000374501 1117 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AQP7-204ENST00000379506 1062 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MIR658-201ENST00000385210 100 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 RPS2P32-201ENST00000439199 892 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC012173.1-201ENST00000567942 430 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 SRD5A3P1-201ENST00000603021 949 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC004461.2-201ENST00000629517 803 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 PRSS36-207ENST00000569305 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
CYP2C9P11712 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 MCCC1-201ENST00000265594 2545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 PIMREG-201ENST00000250056 1473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 MXRA8-209ENST00000477278 2728 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 SMPD4-202ENST00000409031 4896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 FKBP11-203ENST00000453172 959 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 AL589987.1-201ENST00000453380 819 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 SERBP1P3-201ENST00000459980 809 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 SLC30A5-203ENST00000502979 681 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 AC083973.1-206ENST00000518213 815 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 AP003385.5-201ENST00000533876 555 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CYP2C9P11712 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.9 ms